染色体上の着目箇所を可視化する R パッケージ chromoMap についてご紹介！

カラースケール調整に関する、ggplot2 の 3 つの関数についてご紹介！

各クラスタや各サンプルの細胞割合を、積み上げ棒グラフで可視化する方法をご紹介！

nf-coreで公開されているNextflowパイプラインをカスタマイズする方法について解説

Nextflowを利用して、RNA-seqパイプラインを実行する方法について解説

Nextflowの基本的な使い方について解説

バイオインフォマティクス解析で使用されるNextflow言語について解説

シングルセル解析パッケージ Seurat の FindConservedMarkers() 関数を用いて、異なるサンプルで共通しているマーカー遺伝子を調べる方法について説明！

BGIシーケンサーデータに対する問い合わせが増えてきたため、Trimmomaticを使ってアダプター配列除去を行う方法をお教えします。

Reactome のデータを使うことで、第二階層のパスウェイを検索する方法を紹介！

rcloneを使ったExcelファイルの転送には注意が必要

irisがおなじみ、Rの標準データセットや、インストールしたパッケージごとの付属データセットを確認する方法を紹介します。これで新しいパッケージの動作確認もらくらく！？

R パッケージ EnhancedVolcanoを用いて、Volcano Plot を綺麗に描く方法をご紹介します。

RNA-seqのデータから発現変動遺伝子（DEG）を経験ベイズモデルで検出するプログラムEBSeqの紹介です。多群比較においてDEGを検出する考え方と方法を丁寧に紹介します。

Seurat と Monocle のプロットの配色について解説

Rで最初から使える関数（base パッケージ）や、追加の fsパッケージを使って、パスやファイル操作を扱うことができます。 fsパッケージとの違いや、活用方法を２つ紹介します。「ディレクトリを作る・保存先パスを指定する」

scRNA-seq解析の定番であるSeuratを使った複数のデータセットを統合する手順〜IntegrateDataとmergeによる統合の違いを解説します。

SingularityコンテナをSandboxを使って編集する方法について

エンジニア・マネージャー数名で"朝会"（あさかい）を始めました。リモートワークでは毎日集まり会話するのは貴重な時間かも！いま感じている効果とデメリットをまとめます

scRNA-seq解析のSeuratを使って、オブジェクトからraw countデータ・正規化データなどを選んで呼び出す方法。 難しい「slot」についても解説！

アラインメントファイル（BAM）から、「Depthが10以上のゲノム領域」を示す領域ファイル（BED）を作成する方法を丁寧に解説。便利なソフトウェアbedtoolsのインストール方法も紹介。

edgeR を用いたRNA-seq の発現比較において比較群を定義する時のポイント。これがコントロール群、あれが比較群だよ、とバッチリ指定しましょう！【コマンド例あり】

NGSデータを用いた研究にあたり、測定や解析を内製化するか、外部委託するかはポイントになります。こんな方にオススメ・利用例を公開！

Linuxサーバで、ダウンロードした好きなデータベースを参照して blastnを実行する方法

Linux、R、Pythonのおすすめ入門書です。新入社員も読んでいます！

Volcano plotを描くために、SeuratのFindmarkers() 関数のオプションを少し工夫します。

16S rDNA メタゲノム解析で使われるデータベース、SILVAとgreengenesの違い

Rパッケージ "ReactomeContentService4R" の getPathways() 関数を使って、Reactome Pathwayの最上位のPathway名を検索する。

巷で噂の知らないとおじさん？なLinuxコマンドをまとめました。Linuxエンジニアとしては、最新のLinuxコマンドやオプションを随時アップデートしたいものです。

PythonライブラリのSeleniumでスクレイピングを行う方法を細かく解説します。情報収集や業務効率化に役立ちます！