アメリエフの技術ブログ

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R実践:データの可視化と関数活用【BI入門②】
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統計解析ソフトRでのデータ操作と可視化を解説。関数電卓としての利用や、散布図・ヒストグラム作成の基礎を解説します。
11日前
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airwayデータでGSEA解析やってみた:ORAとの違いも解説【前編】
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本記事では、R環境でのGSEA(Gene Set Enrichment Analysis)解析の実践的な流れを、airwayパッケージの公開データを用いて丁寧に解説しています。ヒト気道平滑筋細胞に対するステロイド処理の有無による発現変動をDESeq2で解析し、その結果をもとにエンリッチメント解析の準備までを行います。
21日前
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JupyterLabを使ってみよう【Python】
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Pythonの統合開発環境JupyterLabのご紹介!
1ヶ月前
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知らないと損する!肥大化したWSL2のディスク容量を解放し、Docker環境をクリーンに保つベストプラクティス
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WindowsのWSL2(Windows Subsystem for Linux 2)とDockerを使用する人が直面しがちな「Cドライブの容量が突然ゼロになる」問題について、その原因と具体的な解決策を解説
1ヶ月前
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R入門:環境構築と基本操作【BI入門①】
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バイオインフォマティクスを独学で学ぶ方に向け、統計解析ソフトRの各OSでの動作や実行環境の選び方、Rの基本をご紹介します。
2ヶ月前
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今さら聞けない仮想環境【Docker】
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仮想環境とは?仮想環境の利点、dockerの紹介と導入方法のご紹介
2ヶ月前
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WindowsでLinux環境を作る:WSL2の導入【ドライ解析への大きな一歩】
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Windows PC上にLinux の仮想環境を作る WSL2(Windows Subsystem for Linux version 2)の導入方法をご紹介します!
3ヶ月前
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【シングルセル解析】凡例の順番を変える【Seurat】
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Seuratを用いたシングルセル解析の可視化における凡例の操作方法についてご紹介!
3ヶ月前
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【シングルセル解析】クオリティコントロールの概要【QC】
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シングルセル解析におけるクオリティコントロール (QC) の基本的な概念を解説!
4ヶ月前
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2025年度入社のkazsakの自己紹介
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2025年度入社kazsakの自己紹介
5ヶ月前
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バイオインフォマティクスで迷わない!R と Python の選び方
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R と Python の選び方について、現役のバイオインフォマティシャンが解説!
5ヶ月前
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venn.diagram のリストと引数の関係について
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Rパッケージ venn.diagram を用いて2円のベン図を描画する際の注意点をご紹介します。
6ヶ月前
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【Linux】tmux入門
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ターミナル操作で便利なツールtmuxのご紹介
6ヶ月前
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ynukiの自己紹介
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2022年に入社したynukiの自己紹介文
7ヶ月前
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2023年度入社の hosor の自己紹介
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2023年に新卒入社した hosor の自己紹介
8ヶ月前
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2023年度入社のkutsuyでございます。
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2023年に中途入社したkutsuwadayの自己紹介編
9ヶ月前
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自己紹介【nakagawam】
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2024年に中途入社したnakagawamの自己紹介
10ヶ月前
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【Docker】仮想環境まわりのデータ形式の変換方法【Apptainer (Singularity)】
アメリエフの技術ブログ
仮想環境 (Docker など) まわりのデータ形式の変換コマンドをご紹介!
1年前
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【シングルセル解析】クラスタリング樹形図を描画する方法【clustree】
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R パッケージ clustree を用いて、クラスタリング樹形図 (clustering tree) を描画する方法をご紹介!
1年前
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【シングルセル解析】Seurat で公開データを読み込む方法 3 選
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Seurat で公開データを読み込む方法を 3 つご紹介!
1年前
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【機械学習】乳がんのデータセットから悪性か良性か予測する【Python】
アメリエフの技術ブログ
必要最小限の Python スクリプトで、乳がんのデータセットから悪性か良性か予測する機械学習モデルを構築!
1年前
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【R】解析結果を保存しておく方法 3 選
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R で解析途中の結果を保存しておく方法 3 選!
2年前
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【R】染色体上の着目箇所を可視化
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染色体上の着目箇所を可視化する R パッケージ chromoMap についてご紹介!
2年前
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【R】ヒートマップのカラースケールの調整方法
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カラースケール調整に関する、ggplot2 の 3 つの関数についてご紹介!
2年前
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【シングルセル解析】各サンプルの細胞割合を積み上げ棒グラフで描画
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各クラスタや各サンプルの細胞割合を、積み上げ棒グラフで可視化する方法をご紹介!
2年前
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Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー(4/4)
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nf-coreで公開されているNextflowパイプラインをカスタマイズする方法について解説
2年前
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Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー(3/4)
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Nextflowを利用して、RNA-seqパイプラインを実行する方法について解説
2年前
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Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー(2/4)
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Nextflowの基本的な使い方について解説
2年前
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Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー(1/4)
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バイオインフォマティクス解析で使用されるNextflow言語について解説
2年前
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【シングルセル解析】サンプル間で共通するマーカー遺伝子の検出方法
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シングルセル解析パッケージ Seurat の FindConservedMarkers() 関数を用いて、異なるサンプルで共通しているマーカー遺伝子を調べる方法について説明!
2年前