アメリエフの技術ブログ

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【シングルセル解析】凡例の順番を変える【Seurat】
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Seuratを用いたシングルセル解析の可視化における凡例の操作方法についてご紹介!
13日前
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【シングルセル解析】クオリティコントロールの概要【QC】
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シングルセル解析におけるクオリティコントロール (QC) の基本的な概念を解説!
1ヶ月前
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2025年度入社のkazsakの自己紹介
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2025年度入社kazsakの自己紹介
2ヶ月前
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バイオインフォマティクスで迷わない!R と Python の選び方
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R と Python の選び方について、現役のバイオインフォマティシャンが解説!
2ヶ月前
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venn.diagram のリストと引数の関係について
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Rパッケージ venn.diagram を用いて2円のベン図を描画する際の注意点をご紹介します。
3ヶ月前
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【Linux】tmux入門
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ターミナル操作で便利なツールtmuxのご紹介
3ヶ月前
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ynukiの自己紹介
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2022年に入社したynukiの自己紹介文
4ヶ月前
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2023年度入社の hosor の自己紹介
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2023年に新卒入社した hosor の自己紹介
5ヶ月前
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2023年度入社のkutsuyでございます。
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2023年に中途入社したkutsuwadayの自己紹介編
6ヶ月前
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自己紹介【nakagawam】
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2024年に中途入社したnakagawamの自己紹介
7ヶ月前
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【Docker】仮想環境まわりのデータ形式の変換方法【Apptainer (Singularity)】
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仮想環境 (Docker など) まわりのデータ形式の変換コマンドをご紹介!
8ヶ月前
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【シングルセル解析】クラスタリング樹形図を描画する方法【clustree】
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R パッケージ clustree を用いて、クラスタリング樹形図 (clustering tree) を描画する方法をご紹介!
1年前
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【シングルセル解析】Seurat で公開データを読み込む方法 3 選
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Seurat で公開データを読み込む方法を 3 つご紹介!
1年前
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【機械学習】乳がんのデータセットから悪性か良性か予測する【Python】
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必要最小限の Python スクリプトで、乳がんのデータセットから悪性か良性か予測する機械学習モデルを構築!
1年前
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【R】解析結果を保存しておく方法 3 選
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R で解析途中の結果を保存しておく方法 3 選!
1年前
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【R】染色体上の着目箇所を可視化
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染色体上の着目箇所を可視化する R パッケージ chromoMap についてご紹介!
1年前
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【R】ヒートマップのカラースケールの調整方法
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カラースケール調整に関する、ggplot2 の 3 つの関数についてご紹介!
2年前
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【シングルセル解析】各サンプルの細胞割合を積み上げ棒グラフで描画
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各クラスタや各サンプルの細胞割合を、積み上げ棒グラフで可視化する方法をご紹介!
2年前
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Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー(4/4)
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nf-coreで公開されているNextflowパイプラインをカスタマイズする方法について解説
2年前
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Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー(3/4)
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Nextflowを利用して、RNA-seqパイプラインを実行する方法について解説
2年前
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Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー(2/4)
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Nextflowの基本的な使い方について解説
2年前
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Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー(1/4)
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バイオインフォマティクス解析で使用されるNextflow言語について解説
2年前
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【シングルセル解析】サンプル間で共通するマーカー遺伝子の検出方法
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シングルセル解析パッケージ Seurat の FindConservedMarkers() 関数を用いて、異なるサンプルで共通しているマーカー遺伝子を調べる方法について説明!
2年前
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TrimmomaticによるBGISEQデータのアダプター配列除去方法について
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BGIシーケンサーデータに対する問い合わせが増えてきたため、Trimmomaticを使ってアダプター配列除去を行う方法をお教えします。
2年前
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Reactome において第二階層のパスウェイを検索する方法
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Reactome のデータを使うことで、第二階層のパスウェイを検索する方法を紹介!
2年前
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Excelファイルをrcloneで転送する際に困った話
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rcloneを使ったExcelファイルの転送には注意が必要
3年前
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Rパッケージの付属データの確認方法
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irisがおなじみ、Rの標準データセットや、インストールしたパッケージごとの付属データセットを確認する方法を紹介します。これで新しいパッケージの動作確認もらくらく!?
3年前
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Volcano Plot を綺麗に描きたい
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R パッケージ EnhancedVolcanoを用いて、Volcano Plot を綺麗に描く方法をご紹介します。
3年前
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EBSeqの使い方(三群以上の多群比較)
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RNA-seqのデータから発現変動遺伝子(DEG)を経験ベイズモデルで検出するプログラムEBSeqの紹介です。多群比較においてDEGを検出する考え方と方法を丁寧に紹介します。
3年前
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Seurat や Monocle のプロットの配色を調べる
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Seurat と Monocle のプロットの配色について解説
3年前